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生物知識

環境微生物DNA提取方法的突破

作者:admin 來源:丁香通 發布時間: 2014-09-21 22:11  瀏覽次數:
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農藥、除草劑、各種污染物、人工合成物等異生物質,對環境和土壤微生物的多樣性、種群變化產生明顯影響;轉基因作物是否發生土壤基因轉移的檢測,轉基因作物的安全性評價等方面的研究,都需要準確的提取高質量的DNA進行檢測。
土壤中可培養的微生物可能不及所有微生物總數的0.3%,常規提取DNA的方法很難提取到DNA,很難把土壤中的腐殖酸去除干凈,而微量的腐殖酸就可能導致PCR失敗。
目前國際上商用的試劑盒雖然能提取到土壤中微生物的DNA,但由于破碎方法采用玻璃珠或者鋼珠破碎,導致基因組斷裂嚴重,影響DNA質量;第二,由于必須購買破碎專用的破碎機或振蕩器,增加其使用成本;第三,其試劑盒為了保證DNA純度,采用了包括玻璃奶、離心吸附柱串聯的純化方式,導致了DNA大量的損失,得率很低,很難真正反映出土壤中微生物的多樣性。百泰克推出的土壤基因組DNA快速提取試劑盒(DP4001)采用創新技術,摒棄了機械破碎細胞的方法,采用酶法破碎,保證了基因組的完整性,摒棄了玻璃奶、離心吸附柱串聯純化DNA的方式,極大的提高了DNA的得率,幾乎土壤中所有的微生物DNA都能提取出來,能真正反映土壤中微生物的多樣性。

產品名
基因組裂解方法
純化得率
實驗設備
BioTeke Soil Genomic DNA Rapid Extraction Kit
酶法破碎基因組完整 特制純化柱得率純度高 時間1小時內不需要特殊設備
FastDNA® SPIN Kit 鋼珠破碎基因組斷裂 玻璃奶離心吸附柱純化得率低 時間2小時需要專門破碎設備
UltraClean™ Soil DNA Isolation Kit 玻璃珠破碎基因組斷裂 離心吸附柱純化得率低 時間2小時需要專門震蕩器

玻璃奶純化得率60-75% ,離心吸附柱純化得率60-80% ,百泰克的產品因為不使用玻璃奶和離心吸附柱純化,直接用異丙醇沉淀,能極大的避免DNA的損失。

 

FastDNA® SPIN Kit for Soil網址鏈接http://www.mobfastly.com/a/gb2312/yiqi/MP%20Bio/2012/0802/4857.html

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